一、外观不同
蜜蜂窝是蜜蜂哺育幼虫和储存蜂蜜的地方，野生蜂群一般将巢筑在隐秘的岩洞或树洞中，家养蜜蜂则筑巢在蜂箱中，整个蜂巢由多个垂直于地表的巢脾组成，而马蜂窝根据马蜂的种类不同有不同的外观，小型马蜂的巢穴看起来像向日葵，大型马蜂的巢穴规模比较庞大，外观看起来像个球体，而蜂巢则包裹在球体里面。
二、材质不同
蜜蜂窝是由蜂群内适龄工蜂腹部蜡腺分泌的蜂蜡制作而成的，将蜜蜂窝融化后可以得到蜂蜡，比较奇特的是蜂群中的工蜂只在10～20日龄之间能分泌蜂蜡，之前或之后都不能分泌蜂蜡，而马蜂多用浸软的似纸浆般的木浆造巢，马蜂中的工蜂在咀嚼吞下干燥的植物材料后又将其回吐出来并与唾液混合用以构成纸样的巢。
三、结构不同
蜜蜂窝由数张呈片状并与地面垂直的构成，巢脾数量因蜂种和群势而异，例如群势较强的中蜂一般有7～8张，但每张巢脾之间有一定的距离，从而构成了看似分散但有紧密联系的蜂巢，而马蜂窝的结构根据蜂种不同差异非常大，小型马蜂的巢结构比较简单，大型马蜂的巢为多层结构，外部有巢壳包裹，巢门开在下部。
四、巢址不同
蜜蜂对巢址的要求非常高，不但要求冬暖夏凉，而且要求周围蜜源丰富且能抵御天敌危害，因此一般在隐秘的土洞、岩洞或树洞中筑巢，而马蜂因种类不同筑巢习性也不同，小型马蜂多在石缝、灌木丛、屋檐下等相对隐秘的地方筑巢，大型马蜂有些在高大的树枝上筑巢，有些在岩洞、树洞中筑巢，有些会掘土洞筑巢。
总结：蜜蜂和马蜂是最常见的两种蜂类，很多人常将其混为一谈，但两者的习性有着千差万别，假若遇到蜜蜂窝算得上是意外之喜，而遇到马蜂窝若没有那个实力的话还是敬而远之的为好。
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