一、难养成强群
中蜂群势相对较小，单王很难维持大群，因此很多人采用双王群以改变这一现状，理论上讲双王群相当于在一个蜂箱中有两只蜂王同时产卵，在相同条件下两只蜂王在同等时间内绝对会比一只蜂王产卵量要多，因此也容易养成强群，但事实上中蜂双王群难以养成强群，两区的蜂量很难超过3脾的。
二、蜂群易偏集
中蜂双王群容易导致蜜蜂偏集，其主要原因一是两只蜂王分泌的蜂王信息素有强有弱，从而对蜜蜂吸引力会表现出差异，二是因为养蜂者对两区巢门间距离的理解有偏差，认为两区巢门越远越有利于防止蜂群偏集，然而问题恰恰出在这里，一个蜂箱两个巢门再远也绝对不可能达到防迷巢的距离。
三、蜂群易混乱
中蜂双王群中同时存在两只蜂王，因此群内的“蜂王信息素”可能会比较混乱，导致工蜂出勤不正常，而且在夏季高温天气时蜂群内温度相对会比较高，因此较难以维持强群，同时在蜜源充足时蜂群会加大繁殖力度而导致蜂群里全是蛹，在蜜源不足时又起不到双王繁殖的作用。
四、管理较麻烦
中蜂双王群在日常管理方面也比较麻烦，要求饲养者要时刻注意两群蜂王的情况，尤其是双王“串门”的情况，在蜂群起分蜂热时如一群起分蜂热两群均起分蜂热，分蜂时一群分蜂两群蜂都会跑出来，同时中蜂双王群会影响处女王交尾，因为女王交尾时容易误投而导致交尾失败。
五、病害难防治
中蜂双王群虽然在抗病、抗盗蜂、抗敌害等方面有一定的优势，但在治病防害方面也非常麻烦，如果一群得病另一群也会跟着遭殃，必须进行同防同治，而且在有胡蜂等敌害侵袭的时候由于两群蜂的气味比较混乱而很容易出现同箱两群蜂互相厮杀的情况，从而使蜂群造成不必要的死伤。
总结：中蜂双王群的优势体现在冬季和春季，冬季双王群巢内温度高，消耗饲料少，群势下降也少，春繁双王群巢内温度高，蜂群育虫积极，只要饲料充足蜂群发展得非常快。
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